Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARB2Q14108 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCARB2Q14108 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARB2Q14108 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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