Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX2Q13950 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX2Q13950 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RUNX2Q13950 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
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