Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
SHROOM2Q13796 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
SHROOM2Q13796 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.95
SHROOM2Q13796 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
SHROOM2Q13796 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC39.75■■■■□ 3.95
SHROOM2Q13796 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
SHROOM2Q13796 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
SHROOM2Q13796 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
SHROOM2Q13796 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
SHROOM2Q13796 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
SHROOM2Q13796 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SHROOM2Q13796 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SHROOM2Q13796 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
SHROOM2Q13796 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SHROOM2Q13796 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SHROOM2Q13796 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SHROOM2Q13796 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
SHROOM2Q13796 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
SHROOM2Q13796 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SHROOM2Q13796 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SHROOM2Q13796 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SHROOM2Q13796 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SHROOM2Q13796 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SHROOM2Q13796 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SHROOM2Q13796 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
SHROOM2Q13796 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SHROOM2Q13796 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SHROOM2Q13796 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
SHROOM2Q13796 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
SHROOM2Q13796 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
SHROOM2Q13796 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
SHROOM2Q13796 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SHROOM2Q13796 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SHROOM2Q13796 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.92
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