Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNAPC2Q13487 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNAPC2Q13487 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SNAPC2Q13487 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNAPC2Q13487 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
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