Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRDNQ13061 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRDNQ13061 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TRDNQ13061 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRDNQ13061 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
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