Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRTAP1-1Q07627 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRTAP1-1Q07627 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms