Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIGFQ07326 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIGFQ07326 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIGFQ07326 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms