Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PSME1Q06323 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PSME1Q06323 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PSME1Q06323 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PSME1Q06323 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms