Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA1Q02410 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APBA1Q02410 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APBA1Q02410 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.1 ms