Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BEX3Q00994 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BEX3Q00994 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
BEX3Q00994 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms