Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCCQ00597 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FANCCQ00597 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCCQ00597 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FANCCQ00597 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FANCCQ00597 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 447.3 ms