Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3F3AP84243 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3F3AP84243 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
H3F3AP84243 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H3F3AP84243 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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