Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFI35P80217 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFI35P80217 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFI35P80217 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFI35P80217 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFI35P80217 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFI35P80217 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IFI35P80217 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFI35P80217 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFI35P80217 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFI35P80217 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFI35P80217 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFI35P80217 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFI35P80217 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFI35P80217 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFI35P80217 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFI35P80217 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFI35P80217 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IFI35P80217 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFI35P80217 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFI35P80217 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFI35P80217 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFI35P80217 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFI35P80217 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFI35P80217 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFI35P80217 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFI35P80217 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFI35P80217 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFI35P80217 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFI35P80217 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFI35P80217 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IFI35P80217 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
IFI35P80217 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFI35P80217 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFI35P80217 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFI35P80217 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFI35P80217 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFI35P80217 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFI35P80217 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFI35P80217 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFI35P80217 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IFI35P80217 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFI35P80217 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFI35P80217 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFI35P80217 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFI35P80217 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFI35P80217 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFI35P80217 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFI35P80217 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFI35P80217 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFI35P80217 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFI35P80217 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFI35P80217 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFI35P80217 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFI35P80217 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFI35P80217 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFI35P80217 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFI35P80217 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFI35P80217 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFI35P80217 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFI35P80217 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFI35P80217 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFI35P80217 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFI35P80217 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFI35P80217 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IFI35P80217 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFI35P80217 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFI35P80217 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFI35P80217 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFI35P80217 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFI35P80217 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFI35P80217 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFI35P80217 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFI35P80217 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFI35P80217 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFI35P80217 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFI35P80217 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFI35P80217 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFI35P80217 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFI35P80217 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFI35P80217 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFI35P80217 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFI35P80217 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFI35P80217 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFI35P80217 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFI35P80217 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFI35P80217 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IFI35P80217 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFI35P80217 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFI35P80217 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFI35P80217 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFI35P80217 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFI35P80217 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFI35P80217 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFI35P80217 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IFI35P80217 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFI35P80217 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFI35P80217 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFI35P80217 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFI35P80217 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms