Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GTF2IP78347 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF2IP78347 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTF2IP78347 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTF2IP78347 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms