Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSNK2A1P68400 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK2A1P68400 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms