Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP1CAP62136 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1CAP62136 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1CAP62136 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms