Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME3P61289 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME3P61289 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME3P61289 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME3P61289 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME3P61289 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME3P61289 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME3P61289 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME3P61289 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME3P61289 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME3P61289 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME3P61289 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME3P61289 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME3P61289 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME3P61289 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME3P61289 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME3P61289 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME3P61289 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME3P61289 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME3P61289 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME3P61289 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME3P61289 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME3P61289 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME3P61289 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME3P61289 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME3P61289 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME3P61289 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME3P61289 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME3P61289 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME3P61289 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME3P61289 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME3P61289 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME3P61289 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME3P61289 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME3P61289 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME3P61289 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSME3P61289 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME3P61289 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME3P61289 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME3P61289 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME3P61289 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME3P61289 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME3P61289 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME3P61289 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME3P61289 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME3P61289 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME3P61289 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME3P61289 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME3P61289 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME3P61289 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME3P61289 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME3P61289 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME3P61289 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME3P61289 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME3P61289 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME3P61289 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME3P61289 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME3P61289 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME3P61289 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME3P61289 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME3P61289 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME3P61289 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME3P61289 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME3P61289 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME3P61289 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME3P61289 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME3P61289 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME3P61289 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME3P61289 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME3P61289 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME3P61289 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME3P61289 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME3P61289 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME3P61289 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME3P61289 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME3P61289 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME3P61289 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME3P61289 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME3P61289 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME3P61289 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME3P61289 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME3P61289 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME3P61289 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME3P61289 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME3P61289 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME3P61289 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME3P61289 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME3P61289 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME3P61289 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME3P61289 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME3P61289 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSME3P61289 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME3P61289 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME3P61289 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME3P61289 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME3P61289 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME3P61289 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME3P61289 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME3P61289 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSME3P61289 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms