Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCE1P61221 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCE1P61221 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCE1P61221 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCE1P61221 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.3 ms