Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF3P61204 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARF3P61204 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARF3P61204 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARF3P61204 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF3P61204 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF3P61204 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF3P61204 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF3P61204 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF3P61204 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF3P61204 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARF3P61204 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF3P61204 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF3P61204 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF3P61204 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF3P61204 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF3P61204 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF3P61204 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARF3P61204 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF3P61204 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF3P61204 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF3P61204 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF3P61204 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARF3P61204 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF3P61204 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF3P61204 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF3P61204 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF3P61204 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF3P61204 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF3P61204 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ARF3P61204 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARF3P61204 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARF3P61204 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARF3P61204 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARF3P61204 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARF3P61204 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARF3P61204 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF3P61204 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF3P61204 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF3P61204 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF3P61204 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF3P61204 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF3P61204 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF3P61204 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF3P61204 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF3P61204 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF3P61204 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF3P61204 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF3P61204 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF3P61204 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF3P61204 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF3P61204 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF3P61204 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF3P61204 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF3P61204 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF3P61204 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF3P61204 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF3P61204 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF3P61204 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF3P61204 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF3P61204 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF3P61204 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF3P61204 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF3P61204 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF3P61204 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF3P61204 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF3P61204 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF3P61204 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF3P61204 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF3P61204 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF3P61204 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARF3P61204 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF3P61204 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARF3P61204 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF3P61204 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF3P61204 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF3P61204 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF3P61204 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF3P61204 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF3P61204 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF3P61204 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF3P61204 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARF3P61204 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF3P61204 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF3P61204 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF3P61204 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF3P61204 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF3P61204 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF3P61204 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF3P61204 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARF3P61204 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF3P61204 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF3P61204 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF3P61204 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF3P61204 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF3P61204 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF3P61204 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARF3P61204 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARF3P61204 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARF3P61204 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms