Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTP1P59025 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTP1P59025 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTP1P59025 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTP1P59025 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RTP1P59025 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTP1P59025 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTP1P59025 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RTP1P59025 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTP1P59025 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTP1P59025 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTP1P59025 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTP1P59025 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTP1P59025 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTP1P59025 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTP1P59025 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTP1P59025 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTP1P59025 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTP1P59025 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RTP1P59025 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTP1P59025 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTP1P59025 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RTP1P59025 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTP1P59025 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTP1P59025 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTP1P59025 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTP1P59025 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTP1P59025 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTP1P59025 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTP1P59025 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTP1P59025 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTP1P59025 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTP1P59025 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTP1P59025 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTP1P59025 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RTP1P59025 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTP1P59025 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTP1P59025 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTP1P59025 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTP1P59025 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTP1P59025 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTP1P59025 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTP1P59025 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTP1P59025 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTP1P59025 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTP1P59025 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RTP1P59025 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RTP1P59025 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RTP1P59025 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTP1P59025 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTP1P59025 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RTP1P59025 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTP1P59025 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTP1P59025 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTP1P59025 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTP1P59025 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTP1P59025 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RTP1P59025 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP1P59025 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP1P59025 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP1P59025 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP1P59025 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTP1P59025 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTP1P59025 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTP1P59025 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTP1P59025 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTP1P59025 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTP1P59025 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTP1P59025 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTP1P59025 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTP1P59025 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTP1P59025 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTP1P59025 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTP1P59025 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTP1P59025 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTP1P59025 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTP1P59025 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTP1P59025 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTP1P59025 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RTP1P59025 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTP1P59025 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTP1P59025 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTP1P59025 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTP1P59025 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTP1P59025 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTP1P59025 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTP1P59025 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTP1P59025 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTP1P59025 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RTP1P59025 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RTP1P59025 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTP1P59025 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RTP1P59025 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTP1P59025 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTP1P59025 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTP1P59025 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTP1P59025 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTP1P59025 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTP1P59025 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTP1P59025 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms