Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB38P57729 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB38P57729 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB38P57729 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB38P57729 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB38P57729 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB38P57729 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB38P57729 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB38P57729 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB38P57729 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB38P57729 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB38P57729 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB38P57729 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB38P57729 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB38P57729 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB38P57729 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB38P57729 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB38P57729 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB38P57729 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB38P57729 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB38P57729 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB38P57729 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB38P57729 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB38P57729 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB38P57729 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB38P57729 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB38P57729 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB38P57729 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB38P57729 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB38P57729 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB38P57729 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB38P57729 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB38P57729 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB38P57729 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB38P57729 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB38P57729 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB38P57729 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB38P57729 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB38P57729 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB38P57729 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB38P57729 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB38P57729 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB38P57729 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB38P57729 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB38P57729 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB38P57729 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB38P57729 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB38P57729 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB38P57729 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB38P57729 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB38P57729 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB38P57729 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB38P57729 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB38P57729 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB38P57729 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB38P57729 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB38P57729 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB38P57729 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB38P57729 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB38P57729 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB38P57729 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB38P57729 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB38P57729 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB38P57729 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB38P57729 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB38P57729 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB38P57729 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB38P57729 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB38P57729 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB38P57729 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB38P57729 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB38P57729 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB38P57729 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB38P57729 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB38P57729 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB38P57729 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB38P57729 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB38P57729 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB38P57729 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB38P57729 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB38P57729 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB38P57729 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB38P57729 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB38P57729 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB38P57729 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB38P57729 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB38P57729 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB38P57729 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB38P57729 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB38P57729 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB38P57729 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB38P57729 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB38P57729 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB38P57729 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB38P57729 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB38P57729 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB38P57729 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB38P57729 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB38P57729 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB38P57729 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms