Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAA2P54646 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKAA2P54646 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms