Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CACNB3P54284 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNB3P54284 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CACNB3P54284 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNB3P54284 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms