Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLNS1AP54105 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLNS1AP54105 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLNS1AP54105 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLNS1AP54105 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.8 ms