Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF2A2P52657 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2A2P52657 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2A2P52657 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms