Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSRP3P50461 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSRP3P50461 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRP3P50461 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms