Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD8P48556 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD8P48556 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMD8P48556 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms