Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF4P48230 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TM4SF4P48230 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms