Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UTRNP46939 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
UTRNP46939 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UTRNP46939 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
UTRNP46939 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
UTRNP46939 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
UTRNP46939 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
UTRNP46939 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
UTRNP46939 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
UTRNP46939 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
UTRNP46939 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
UTRNP46939 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
UTRNP46939 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
UTRNP46939 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
UTRNP46939 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
UTRNP46939 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
UTRNP46939 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
UTRNP46939 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
UTRNP46939 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
UTRNP46939 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
UTRNP46939 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
UTRNP46939 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
UTRNP46939 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
UTRNP46939 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
UTRNP46939 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
UTRNP46939 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
UTRNP46939 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UTRNP46939 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.67■■■□□ 2.5
UTRNP46939 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
UTRNP46939 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UTRNP46939 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
UTRNP46939 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
UTRNP46939 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
UTRNP46939 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
UTRNP46939 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
UTRNP46939 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
UTRNP46939 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
UTRNP46939 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
UTRNP46939 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
UTRNP46939 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
UTRNP46939 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UTRNP46939 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UTRNP46939 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
UTRNP46939 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
UTRNP46939 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
UTRNP46939 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
UTRNP46939 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
UTRNP46939 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
UTRNP46939 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
UTRNP46939 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
UTRNP46939 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
UTRNP46939 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
UTRNP46939 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
UTRNP46939 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
UTRNP46939 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
UTRNP46939 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
UTRNP46939 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
UTRNP46939 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
UTRNP46939 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
UTRNP46939 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
UTRNP46939 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
UTRNP46939 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
UTRNP46939 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
UTRNP46939 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
UTRNP46939 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
UTRNP46939 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
UTRNP46939 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
UTRNP46939 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
UTRNP46939 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
UTRNP46939 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
UTRNP46939 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
UTRNP46939 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
UTRNP46939 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
UTRNP46939 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
UTRNP46939 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
UTRNP46939 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
UTRNP46939 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
UTRNP46939 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
UTRNP46939 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
UTRNP46939 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
UTRNP46939 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
UTRNP46939 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
UTRNP46939 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
UTRNP46939 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
UTRNP46939 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
UTRNP46939 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
UTRNP46939 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
UTRNP46939 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
UTRNP46939 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
UTRNP46939 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
UTRNP46939 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
UTRNP46939 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
UTRNP46939 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
UTRNP46939 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
UTRNP46939 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UTRNP46939 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UTRNP46939 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
UTRNP46939 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
UTRNP46939 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
UTRNP46939 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms