Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS9P46781 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS9P46781 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS9P46781 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS9P46781 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS9P46781 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS9P46781 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS9P46781 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS9P46781 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS9P46781 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS9P46781 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS9P46781 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS9P46781 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS9P46781 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS9P46781 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS9P46781 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS9P46781 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS9P46781 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS9P46781 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPS9P46781 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPS9P46781 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS9P46781 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS9P46781 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS9P46781 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS9P46781 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS9P46781 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS9P46781 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS9P46781 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS9P46781 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS9P46781 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS9P46781 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS9P46781 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS9P46781 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS9P46781 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS9P46781 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS9P46781 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS9P46781 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS9P46781 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS9P46781 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS9P46781 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS9P46781 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS9P46781 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS9P46781 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS9P46781 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS9P46781 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS9P46781 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS9P46781 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS9P46781 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS9P46781 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS9P46781 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS9P46781 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS9P46781 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS9P46781 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS9P46781 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS9P46781 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS9P46781 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS9P46781 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS9P46781 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS9P46781 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS9P46781 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS9P46781 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS9P46781 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS9P46781 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS9P46781 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS9P46781 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS9P46781 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS9P46781 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS9P46781 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS9P46781 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS9P46781 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS9P46781 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS9P46781 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS9P46781 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS9P46781 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS9P46781 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS9P46781 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS9P46781 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS9P46781 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS9P46781 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS9P46781 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS9P46781 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS9P46781 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS9P46781 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS9P46781 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS9P46781 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS9P46781 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS9P46781 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS9P46781 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS9P46781 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS9P46781 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPS9P46781 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS9P46781 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS9P46781 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS9P46781 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS9P46781 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS9P46781 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS9P46781 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS9P46781 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS9P46781 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS9P46781 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms