Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL28P46779 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL28P46779 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL28P46779 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL28P46779 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL28P46779 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL28P46779 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL28P46779 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL28P46779 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL28P46779 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL28P46779 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL28P46779 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL28P46779 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL28P46779 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL28P46779 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL28P46779 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL28P46779 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL28P46779 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL28P46779 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL28P46779 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL28P46779 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL28P46779 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL28P46779 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL28P46779 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL28P46779 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL28P46779 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL28P46779 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL28P46779 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL28P46779 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL28P46779 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL28P46779 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL28P46779 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL28P46779 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL28P46779 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL28P46779 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL28P46779 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL28P46779 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL28P46779 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL28P46779 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL28P46779 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL28P46779 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL28P46779 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL28P46779 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL28P46779 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL28P46779 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL28P46779 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL28P46779 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL28P46779 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL28P46779 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL28P46779 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL28P46779 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL28P46779 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL28P46779 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL28P46779 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL28P46779 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL28P46779 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL28P46779 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL28P46779 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL28P46779 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL28P46779 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL28P46779 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL28P46779 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL28P46779 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL28P46779 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL28P46779 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL28P46779 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL28P46779 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL28P46779 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL28P46779 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL28P46779 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL28P46779 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL28P46779 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL28P46779 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL28P46779 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL28P46779 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL28P46779 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL28P46779 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL28P46779 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL28P46779 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL28P46779 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL28P46779 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL28P46779 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL28P46779 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL28P46779 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL28P46779 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL28P46779 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL28P46779 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL28P46779 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL28P46779 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL28P46779 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL28P46779 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL28P46779 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL28P46779 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL28P46779 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL28P46779 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL28P46779 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL28P46779 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL28P46779 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL28P46779 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL28P46779 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms