Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
DCCP43146 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
DCCP43146 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
DCCP43146 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
DCCP43146 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
DCCP43146 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
DCCP43146 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
DCCP43146 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
DCCP43146 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
DCCP43146 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
DCCP43146 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
DCCP43146 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
DCCP43146 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
DCCP43146 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
DCCP43146 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
DCCP43146 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
DCCP43146 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
DCCP43146 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
DCCP43146 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
DCCP43146 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
DCCP43146 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
DCCP43146 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
DCCP43146 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
DCCP43146 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
DCCP43146 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
DCCP43146 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
DCCP43146 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
DCCP43146 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
DCCP43146 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
DCCP43146 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
DCCP43146 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
DCCP43146 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
DCCP43146 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
DCCP43146 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
DCCP43146 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
DCCP43146 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
DCCP43146 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
DCCP43146 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
DCCP43146 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
DCCP43146 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
DCCP43146 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
DCCP43146 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DCCP43146 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
DCCP43146 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
DCCP43146 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCCP43146 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
DCCP43146 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCCP43146 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DCCP43146 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
DCCP43146 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
DCCP43146 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DCCP43146 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DCCP43146 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCCP43146 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCCP43146 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DCCP43146 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCCP43146 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCCP43146 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCCP43146 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCCP43146 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCCP43146 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DCCP43146 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCCP43146 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCCP43146 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCCP43146 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DCCP43146 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DCCP43146 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DCCP43146 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DCCP43146 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
DCCP43146 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DCCP43146 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCCP43146 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCCP43146 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCCP43146 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCCP43146 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DCCP43146 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCCP43146 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
DCCP43146 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCCP43146 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DCCP43146 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
DCCP43146 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DCCP43146 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DCCP43146 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
DCCP43146 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
DCCP43146 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
DCCP43146 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DCCP43146 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
DCCP43146 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
DCCP43146 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DCCP43146 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DCCP43146 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DCCP43146 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DCCP43146 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
DCCP43146 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DCCP43146 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DCCP43146 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DCCP43146 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
DCCP43146 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
DCCP43146 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
DCCP43146 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms