Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF4A3P38919 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF4A3P38919 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms