Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL1P37235 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAL1P37235 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL1P37235 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPCAL1P37235 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPCAL1P37235 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPCAL1P37235 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms