Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNB1P35222 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTNNB1P35222 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNNB1P35222 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNB1P35222 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms