Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP6P35125 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
USP6P35125 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
USP6P35125 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
USP6P35125 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
USP6P35125 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
USP6P35125 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP6P35125 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP6P35125 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP6P35125 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP6P35125 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP6P35125 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP6P35125 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
USP6P35125 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
USP6P35125 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
USP6P35125 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
USP6P35125 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
USP6P35125 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
USP6P35125 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
USP6P35125 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
USP6P35125 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP6P35125 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP6P35125 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP6P35125 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP6P35125 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
USP6P35125 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
USP6P35125 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
USP6P35125 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP6P35125 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP6P35125 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP6P35125 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP6P35125 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP6P35125 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP6P35125 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP6P35125 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP6P35125 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP6P35125 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
USP6P35125 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP6P35125 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP6P35125 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP6P35125 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
USP6P35125 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP6P35125 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP6P35125 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
USP6P35125 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP6P35125 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP6P35125 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP6P35125 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP6P35125 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP6P35125 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP6P35125 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
USP6P35125 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP6P35125 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP6P35125 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP6P35125 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
USP6P35125 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP6P35125 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP6P35125 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP6P35125 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP6P35125 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP6P35125 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP6P35125 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP6P35125 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP6P35125 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
USP6P35125 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
USP6P35125 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP6P35125 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP6P35125 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP6P35125 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP6P35125 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP6P35125 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP6P35125 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP6P35125 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP6P35125 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP6P35125 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP6P35125 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP6P35125 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
USP6P35125 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
USP6P35125 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
USP6P35125 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
USP6P35125 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP6P35125 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP6P35125 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
USP6P35125 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP6P35125 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP6P35125 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP6P35125 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP6P35125 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP6P35125 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP6P35125 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP6P35125 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP6P35125 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP6P35125 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
USP6P35125 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP6P35125 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP6P35125 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP6P35125 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP6P35125 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP6P35125 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP6P35125 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms