Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC12P31275 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC12P31275 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms