Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCND3P30281 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCND3P30281 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCND3P30281 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCND3P30281 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCND3P30281 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCND3P30281 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCND3P30281 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCND3P30281 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCND3P30281 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCND3P30281 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCND3P30281 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCND3P30281 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCND3P30281 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCND3P30281 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCND3P30281 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCND3P30281 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCND3P30281 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCND3P30281 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCND3P30281 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCND3P30281 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCND3P30281 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCND3P30281 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCND3P30281 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCND3P30281 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCND3P30281 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCND3P30281 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCND3P30281 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCND3P30281 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCND3P30281 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCND3P30281 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCND3P30281 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCND3P30281 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCND3P30281 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCND3P30281 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCND3P30281 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCND3P30281 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCND3P30281 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCND3P30281 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCND3P30281 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCND3P30281 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCND3P30281 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCND3P30281 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCND3P30281 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCND3P30281 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCND3P30281 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCND3P30281 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCND3P30281 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCND3P30281 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCND3P30281 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCND3P30281 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCND3P30281 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCND3P30281 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCND3P30281 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCND3P30281 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCND3P30281 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCND3P30281 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCND3P30281 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCND3P30281 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCND3P30281 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCND3P30281 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCND3P30281 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCND3P30281 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCND3P30281 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCND3P30281 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCND3P30281 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCND3P30281 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCND3P30281 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCND3P30281 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCND3P30281 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCND3P30281 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCND3P30281 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCND3P30281 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCND3P30281 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCND3P30281 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCND3P30281 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCND3P30281 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCND3P30281 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCND3P30281 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCND3P30281 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCND3P30281 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCND3P30281 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCND3P30281 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCND3P30281 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCND3P30281 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCND3P30281 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCND3P30281 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCND3P30281 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCND3P30281 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCND3P30281 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCND3P30281 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCND3P30281 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCND3P30281 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCND3P30281 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CCND3P30281 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCND3P30281 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCND3P30281 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCND3P30281 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCND3P30281 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCND3P30281 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms