Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCAP28676 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCAP28676 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCAP28676 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCAP28676 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCAP28676 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCAP28676 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCAP28676 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCAP28676 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCAP28676 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCAP28676 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCAP28676 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCAP28676 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCAP28676 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GCAP28676 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GCAP28676 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCAP28676 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCAP28676 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCAP28676 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GCAP28676 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCAP28676 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCAP28676 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCAP28676 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCAP28676 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCAP28676 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCAP28676 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCAP28676 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCAP28676 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCAP28676 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCAP28676 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCAP28676 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCAP28676 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCAP28676 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCAP28676 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCAP28676 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCAP28676 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCAP28676 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCAP28676 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCAP28676 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCAP28676 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCAP28676 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCAP28676 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCAP28676 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCAP28676 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCAP28676 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCAP28676 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCAP28676 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCAP28676 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCAP28676 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCAP28676 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCAP28676 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCAP28676 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCAP28676 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCAP28676 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCAP28676 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCAP28676 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCAP28676 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCAP28676 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCAP28676 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCAP28676 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCAP28676 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCAP28676 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCAP28676 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCAP28676 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCAP28676 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GCAP28676 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCAP28676 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCAP28676 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCAP28676 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCAP28676 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCAP28676 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCAP28676 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCAP28676 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCAP28676 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCAP28676 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCAP28676 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCAP28676 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCAP28676 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCAP28676 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GCAP28676 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCAP28676 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCAP28676 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCAP28676 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCAP28676 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCAP28676 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCAP28676 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCAP28676 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCAP28676 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCAP28676 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCAP28676 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCAP28676 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCAP28676 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCAP28676 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCAP28676 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCAP28676 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCAP28676 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCAP28676 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCAP28676 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCAP28676 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCAP28676 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms