Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SSFA2P28290 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SSFA2P28290 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SSFA2P28290 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms