Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CALRP27797 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALRP27797 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALRP27797 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALRP27797 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALRP27797 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALRP27797 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CALRP27797 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALRP27797 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALRP27797 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALRP27797 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALRP27797 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALRP27797 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALRP27797 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALRP27797 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALRP27797 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALRP27797 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALRP27797 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALRP27797 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALRP27797 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALRP27797 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALRP27797 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALRP27797 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALRP27797 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALRP27797 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALRP27797 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALRP27797 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALRP27797 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALRP27797 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALRP27797 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALRP27797 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALRP27797 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALRP27797 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALRP27797 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALRP27797 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALRP27797 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CALRP27797 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALRP27797 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALRP27797 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALRP27797 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALRP27797 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALRP27797 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALRP27797 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALRP27797 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALRP27797 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALRP27797 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALRP27797 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CALRP27797 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALRP27797 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALRP27797 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALRP27797 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALRP27797 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALRP27797 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALRP27797 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CALRP27797 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALRP27797 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALRP27797 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALRP27797 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALRP27797 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALRP27797 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALRP27797 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALRP27797 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALRP27797 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALRP27797 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALRP27797 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALRP27797 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALRP27797 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALRP27797 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CALRP27797 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALRP27797 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALRP27797 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALRP27797 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALRP27797 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALRP27797 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALRP27797 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALRP27797 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALRP27797 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALRP27797 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALRP27797 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALRP27797 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALRP27797 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALRP27797 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CALRP27797 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALRP27797 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALRP27797 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALRP27797 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALRP27797 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CALRP27797 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALRP27797 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALRP27797 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALRP27797 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALRP27797 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALRP27797 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALRP27797 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALRP27797 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALRP27797 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALRP27797 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALRP27797 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALRP27797 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALRP27797 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.3 ms