Protein–RNA interactions for Protein: P26010

ITGB7, Integrin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7P26010 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB7P26010 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB7P26010 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB7P26010 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB7P26010 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB7P26010 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB7P26010 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB7P26010 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB7P26010 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB7P26010 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGB7P26010 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB7P26010 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB7P26010 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms