Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TAF1P21675 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TAF1P21675 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TAF1P21675 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TAF1P21675 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TAF1P21675 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TAF1P21675 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TAF1P21675 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TAF1P21675 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TAF1P21675 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TAF1P21675 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TAF1P21675 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TAF1P21675 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TAF1P21675 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TAF1P21675 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TAF1P21675 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
TAF1P21675 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TAF1P21675 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TAF1P21675 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TAF1P21675 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TAF1P21675 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TAF1P21675 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TAF1P21675 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TAF1P21675 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TAF1P21675 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TAF1P21675 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TAF1P21675 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TAF1P21675 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TAF1P21675 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TAF1P21675 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TAF1P21675 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TAF1P21675 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TAF1P21675 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TAF1P21675 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TAF1P21675 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TAF1P21675 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TAF1P21675 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TAF1P21675 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TAF1P21675 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TAF1P21675 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TAF1P21675 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TAF1P21675 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TAF1P21675 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TAF1P21675 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TAF1P21675 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TAF1P21675 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TAF1P21675 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TAF1P21675 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TAF1P21675 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TAF1P21675 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TAF1P21675 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
TAF1P21675 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
TAF1P21675 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TAF1P21675 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TAF1P21675 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TAF1P21675 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TAF1P21675 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TAF1P21675 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TAF1P21675 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
TAF1P21675 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TAF1P21675 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TAF1P21675 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TAF1P21675 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TAF1P21675 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TAF1P21675 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TAF1P21675 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TAF1P21675 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TAF1P21675 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TAF1P21675 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
TAF1P21675 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TAF1P21675 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TAF1P21675 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TAF1P21675 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TAF1P21675 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TAF1P21675 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TAF1P21675 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TAF1P21675 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TAF1P21675 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TAF1P21675 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TAF1P21675 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TAF1P21675 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TAF1P21675 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TAF1P21675 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TAF1P21675 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TAF1P21675 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TAF1P21675 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TAF1P21675 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TAF1P21675 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TAF1P21675 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TAF1P21675 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TAF1P21675 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TAF1P21675 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TAF1P21675 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TAF1P21675 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TAF1P21675 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TAF1P21675 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TAF1P21675 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TAF1P21675 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TAF1P21675 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TAF1P21675 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms