Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACO1P21399 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACO1P21399 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ACO1P21399 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACO1P21399 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACO1P21399 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACO1P21399 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACO1P21399 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ACO1P21399 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACO1P21399 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACO1P21399 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACO1P21399 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACO1P21399 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACO1P21399 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACO1P21399 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACO1P21399 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACO1P21399 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACO1P21399 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACO1P21399 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACO1P21399 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACO1P21399 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACO1P21399 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACO1P21399 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ACO1P21399 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACO1P21399 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACO1P21399 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACO1P21399 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACO1P21399 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACO1P21399 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACO1P21399 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACO1P21399 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACO1P21399 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACO1P21399 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACO1P21399 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACO1P21399 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACO1P21399 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACO1P21399 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ACO1P21399 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACO1P21399 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACO1P21399 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACO1P21399 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACO1P21399 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACO1P21399 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACO1P21399 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACO1P21399 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ACO1P21399 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACO1P21399 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACO1P21399 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACO1P21399 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACO1P21399 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACO1P21399 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACO1P21399 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACO1P21399 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACO1P21399 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACO1P21399 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACO1P21399 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACO1P21399 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACO1P21399 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACO1P21399 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACO1P21399 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACO1P21399 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACO1P21399 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACO1P21399 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACO1P21399 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACO1P21399 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACO1P21399 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACO1P21399 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACO1P21399 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACO1P21399 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACO1P21399 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACO1P21399 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACO1P21399 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACO1P21399 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACO1P21399 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACO1P21399 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACO1P21399 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ACO1P21399 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACO1P21399 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACO1P21399 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACO1P21399 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ACO1P21399 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ACO1P21399 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACO1P21399 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACO1P21399 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACO1P21399 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACO1P21399 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACO1P21399 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ACO1P21399 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACO1P21399 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACO1P21399 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACO1P21399 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACO1P21399 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACO1P21399 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACO1P21399 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACO1P21399 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACO1P21399 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ACO1P21399 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACO1P21399 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACO1P21399 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACO1P21399 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms