Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2CP19387 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2CP19387 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms