Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD58P19256 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD58P19256 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD58P19256 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD58P19256 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD58P19256 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD58P19256 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD58P19256 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD58P19256 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CD58P19256 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD58P19256 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD58P19256 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD58P19256 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD58P19256 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD58P19256 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD58P19256 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD58P19256 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD58P19256 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD58P19256 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD58P19256 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD58P19256 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD58P19256 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD58P19256 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD58P19256 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD58P19256 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD58P19256 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD58P19256 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD58P19256 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD58P19256 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD58P19256 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD58P19256 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD58P19256 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD58P19256 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD58P19256 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD58P19256 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD58P19256 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD58P19256 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD58P19256 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD58P19256 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CD58P19256 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD58P19256 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD58P19256 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD58P19256 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD58P19256 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD58P19256 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD58P19256 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD58P19256 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD58P19256 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD58P19256 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD58P19256 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD58P19256 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD58P19256 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD58P19256 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD58P19256 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CD58P19256 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD58P19256 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD58P19256 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD58P19256 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD58P19256 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD58P19256 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD58P19256 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD58P19256 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD58P19256 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD58P19256 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD58P19256 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD58P19256 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD58P19256 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD58P19256 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD58P19256 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD58P19256 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD58P19256 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CD58P19256 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD58P19256 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD58P19256 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CD58P19256 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD58P19256 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD58P19256 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD58P19256 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD58P19256 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD58P19256 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD58P19256 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD58P19256 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD58P19256 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD58P19256 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CD58P19256 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD58P19256 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CD58P19256 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CD58P19256 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD58P19256 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD58P19256 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD58P19256 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD58P19256 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD58P19256 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD58P19256 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD58P19256 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD58P19256 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD58P19256 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD58P19256 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD58P19256 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD58P19256 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms