Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNNI1P19237 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNI1P19237 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNI1P19237 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms