Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HDCP19113 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDCP19113 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDCP19113 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HDCP19113 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDCP19113 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HDCP19113 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDCP19113 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDCP19113 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDCP19113 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDCP19113 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDCP19113 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDCP19113 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDCP19113 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDCP19113 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDCP19113 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDCP19113 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDCP19113 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDCP19113 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDCP19113 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDCP19113 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDCP19113 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDCP19113 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDCP19113 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDCP19113 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDCP19113 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDCP19113 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HDCP19113 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDCP19113 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDCP19113 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDCP19113 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDCP19113 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDCP19113 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDCP19113 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDCP19113 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDCP19113 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDCP19113 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HDCP19113 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HDCP19113 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDCP19113 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDCP19113 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDCP19113 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDCP19113 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDCP19113 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDCP19113 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDCP19113 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDCP19113 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDCP19113 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDCP19113 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HDCP19113 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDCP19113 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDCP19113 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDCP19113 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDCP19113 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDCP19113 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDCP19113 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDCP19113 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDCP19113 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDCP19113 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDCP19113 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDCP19113 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDCP19113 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDCP19113 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDCP19113 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDCP19113 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDCP19113 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HDCP19113 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDCP19113 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDCP19113 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDCP19113 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDCP19113 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDCP19113 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDCP19113 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDCP19113 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDCP19113 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDCP19113 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDCP19113 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDCP19113 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDCP19113 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDCP19113 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDCP19113 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDCP19113 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDCP19113 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDCP19113 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDCP19113 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDCP19113 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDCP19113 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDCP19113 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDCP19113 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDCP19113 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HDCP19113 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDCP19113 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDCP19113 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDCP19113 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDCP19113 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDCP19113 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDCP19113 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDCP19113 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDCP19113 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HDCP19113 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms