Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPI1P17947 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPI1P17947 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPI1P17947 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPI1P17947 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPI1P17947 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPI1P17947 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPI1P17947 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPI1P17947 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPI1P17947 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPI1P17947 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPI1P17947 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPI1P17947 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPI1P17947 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPI1P17947 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPI1P17947 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPI1P17947 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPI1P17947 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPI1P17947 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPI1P17947 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPI1P17947 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPI1P17947 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPI1P17947 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPI1P17947 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPI1P17947 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPI1P17947 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPI1P17947 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPI1P17947 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPI1P17947 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPI1P17947 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPI1P17947 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPI1P17947 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPI1P17947 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPI1P17947 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPI1P17947 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPI1P17947 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SPI1P17947 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPI1P17947 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPI1P17947 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPI1P17947 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPI1P17947 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SPI1P17947 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPI1P17947 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPI1P17947 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPI1P17947 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPI1P17947 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SPI1P17947 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPI1P17947 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPI1P17947 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPI1P17947 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPI1P17947 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPI1P17947 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPI1P17947 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPI1P17947 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPI1P17947 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPI1P17947 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPI1P17947 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPI1P17947 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPI1P17947 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPI1P17947 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPI1P17947 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPI1P17947 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPI1P17947 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPI1P17947 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPI1P17947 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPI1P17947 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPI1P17947 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPI1P17947 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPI1P17947 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPI1P17947 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPI1P17947 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPI1P17947 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPI1P17947 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPI1P17947 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPI1P17947 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPI1P17947 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPI1P17947 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPI1P17947 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPI1P17947 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPI1P17947 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPI1P17947 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPI1P17947 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPI1P17947 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPI1P17947 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPI1P17947 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPI1P17947 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPI1P17947 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPI1P17947 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPI1P17947 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPI1P17947 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPI1P17947 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPI1P17947 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPI1P17947 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPI1P17947 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPI1P17947 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPI1P17947 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPI1P17947 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPI1P17947 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPI1P17947 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPI1P17947 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms