Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF7P17544 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF7P17544 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF7P17544 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF7P17544 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF7P17544 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF7P17544 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF7P17544 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF7P17544 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF7P17544 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF7P17544 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF7P17544 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF7P17544 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF7P17544 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF7P17544 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF7P17544 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF7P17544 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATF7P17544 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF7P17544 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATF7P17544 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF7P17544 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF7P17544 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF7P17544 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF7P17544 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF7P17544 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF7P17544 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF7P17544 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF7P17544 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF7P17544 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF7P17544 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF7P17544 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF7P17544 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF7P17544 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATF7P17544 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF7P17544 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF7P17544 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF7P17544 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF7P17544 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF7P17544 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATF7P17544 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF7P17544 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF7P17544 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF7P17544 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF7P17544 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF7P17544 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF7P17544 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF7P17544 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF7P17544 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF7P17544 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF7P17544 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATF7P17544 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATF7P17544 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF7P17544 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF7P17544 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF7P17544 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF7P17544 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF7P17544 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF7P17544 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF7P17544 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF7P17544 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF7P17544 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF7P17544 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF7P17544 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF7P17544 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF7P17544 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF7P17544 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF7P17544 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF7P17544 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF7P17544 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF7P17544 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF7P17544 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF7P17544 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF7P17544 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF7P17544 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF7P17544 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF7P17544 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF7P17544 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF7P17544 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF7P17544 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF7P17544 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7P17544 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7P17544 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7P17544 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7P17544 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7P17544 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7P17544 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7P17544 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7P17544 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF7P17544 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7P17544 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7P17544 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7P17544 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7P17544 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF7P17544 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF7P17544 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF7P17544 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF7P17544 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF7P17544 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF7P17544 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF7P17544 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms